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但这个发现并没有解决艾滋病毒的起源问题,反而让它看上去更复杂了。
20世纪80年代,科学家根据艾滋病毒的遗传背景,很巧妙地将之分成两种类型,分别命名为HIV-1和HIV-2。
HIV-1在世界各地都很常见,HIV-2只出现在西非的某些地区,而且攻击性比HIV-1要差很多。
马克斯在白顶白眉猴体内找到的病毒株与HIV-2亲缘关系更近。
马克斯的研究暗示,艾滋病毒并不是单一起源的。HIV-2是从白顶白眉猴携带的SIV病毒独立演化而来,而HIV-1的来源还扑朔迷离。
随着对白顶白眉猴的研究进一步深入,状况更复杂了。科学家发现了几种SIV病毒株,这些不同的SIV病毒都只和某一支HIV-2更接近,和其他HIV-2的关系都比较远。
这个结果说明,在演化的历史中白顶白眉猴所携带的SIV病毒曾多次完成跨物种跳跃,迁移到人类群体,并分别演变成不同的HIV-2病毒株——这个过程竟然多达9次!
没人亲眼目睹过这9次跳跃,但我们对它们的发生过程可以说是非常肯定的。
很多西非人把白顶白眉猴当宠物一样养,猎人也经常捕杀这种猴子,卖它们的肉。
当白顶白眉猴和人发生血液接触——比如猴子咬了猎人,或者屠夫切猴子肉的时候,病毒就有可能从猴子进入人体。
接着,SIV病毒会感染新宿主的细胞,自我复制,并逐渐适应新的宿主。
HIV-1是艾滋病主要的罪魁祸首,搞清楚HIV-1的来源用了更长的时间。
1989年,法国发展研究院(IRD)和蒙彼利埃大学的病毒学家马蒂娜?彼得斯和她的同事们在非洲加蓬的豢养黑猩猩身上发现了一种类似HIV-1的病毒。
为了在野外研究这种病毒,研究人员去到了位于赤道非洲的森林。他们并不是要从黑猩猩体内抽血,因为猿类不仅神出鬼没,身体强壮,而且对手拿针头的人类没什么好感。
取而代之的方法是收集粪便,猿类喜欢把屎拉在树下睡觉的地方。
科学家把粪便带回实验室,从里面寻找病毒的踪迹。结果,不管样品来自东部的喀麦隆还是西部的坦桑尼亚,所有黑猩猩粪便中都分离出了SIV病毒株。
其中喀麦隆南部黑猩猩体内的病毒和HIV-1亲缘关系最近。1999年,科学家综合掌握的线索,画出了病毒的演化树,发现HIV-1的演化过程和HIV-2类似,都是多起源的。
让我们梳理一下。HIV的相关研究人员把世界上所有的HIV-1病毒分成了四组。
其中90%的艾滋病都是由M组病毒导致的,M是main(“主
要”)的简写,表示了这种病毒在HIV家族中的优势地位。
其他病毒株分别属于N、O、P组,数量较少。彼得斯和同事们发现,一种来源于喀麦隆黑猩猩体内的SIV病毒与M组病毒亲缘关系最近。其他黑猩猩病毒和N组相似。O组和P组仍然来源不明。
彼得斯和同事们在森林中搜集黑猩猩粪便的同时,也留心观察了其他灵长类动物。他们足迹所至的某些森林里也有大猩猩出没,于是他们顺便收集了那里的大猩猩粪便,也带回实验室进行研究。
2006年,他们宣布,在喀麦隆的大猩猩体内也找到了SIV病毒。
彼得斯和同事们发现大猩猩体内的SIV也源于黑猩猩,于是他们想仔细了解一下大猩猩SIV同黑猩猩和人类相应的病毒之间到底有什么样的联系。
他们采取了之前的实验方法,从大猩猩的分布区域里系统地收集粪便。但除了在喀麦隆大猩猩体内找到了SIV病毒,他们从其他3000多份大猩猩粪便中一无所获。
在喀麦隆境内,情况则大大不同,这里的大猩猩体内的SIV病毒还不止之前发现的一种。
2015年,彼得斯和她的同事们终于宣布,喀麦隆大猩猩携带的所有SIV病毒株中,两个病毒株被确认为HIV-1病毒O组和P组的祖先,这个发现终于揭开了长久以来的谜团,HIV-1最后两组病毒的身世也尘埃落定。
P组是迄今为止发现的最罕见的艾滋病毒类型,仅从喀麦隆的两位患者体内分离出来过。这一小支病毒似乎只是演化的一次失败尝试,它们不擅长感染人类。
而O组则厉害得多。在喀麦隆,它们已经感染了大约10万人。科学家发现,O组病毒在人体内复制的能力和M组成员一样强。
随着大猩猩SIV病毒的发现,艾滋病毒的演化树终于清晰起来。
SIV病毒反复向人类跳跃,前前后后一共13次,其中9次演化成HIV-2,4次成了HIV-1。
但这些跳跃究竟是在什么时候发生的呢?
为了回答这个问题,一些科学家回过头去检查了HIV病毒被发现之前因为神秘疾病死去的病人。
科学家没有满足,他们希望能深入HIV的基因组,揭开更久远的故事。病毒复制的时候,会以相对固定的速度积累突变,如同沙漏中的沙子一样堆积起来。
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